建于1954年，是新中国成立后党和国家在边陲少数民族地区最早建立的全日制民族中学之一。1954年11月24日，内蒙古自治区教育厅决定，将当时的呼和浩特市第三中学改为内蒙古师范学院（内蒙古师范大学前身）附属中学。1956年7月，内蒙古师范学院附属中学，迁入现校址。 1965 年9月，内蒙古师范学院附属中学改名为“呼和浩特市第十六中学”。1972年3月，“呼和浩特市第十六中学”又恢复名称为“内蒙古师范学院附属中学”。 1982年10月，“内蒙古师范学院”更名为“内蒙古师范大学”，附中也相应更名为“内蒙古师范大学附属中学”。
内蒙古师大附中以“科学、民主、人文、创新”为办学理念，把学生的全面、健康成长和终身发展作为学校各项工作的出发点和目标；以“敦品励学、养志创新”为校训激励全校师生，全面贯彻、落实素质教育，营造张扬个性、施展才华的自我管理、自我服务、自我完善的校园文化氛围。
学校一切工作以学生的发展为中心，为学生一生的成长提供最坚实的基础和生存技能。在长期的教育管理实践中，逐步形成了开放、民主、自由的鲜明特色和多层次全方位的管理体系，提出了“教育重心下移，管理重心前移”、“教学立校，科研兴校”等先进办学思想和理念。
学校各项办学条件和设施均符合国家有关文件标准。学校实验室实验开出率为100%；有先进的语音室、学生机房、多媒体网络教室、课件制作室、电子阅览室、教师电子备课室、多个多媒体教室、中心机房和宽敞明亮的图书阅览室；图书馆藏书104000余册。此外，学校又新增电子图书1万余册，年订杂志500余种，报纸60余种。学校现有400米塑胶跑道的标准操场，有多块篮球场、排球场和近6000平方米的体育馆。学生公寓可为外地学生提供良好的住宿环境，学生在校期间使用磁卡在学生食堂和校园内的商店购买商品。
学校现有教学班53个，其中，汉语授课部有高中班35个，蒙语授课部有高中班12个，初中城市蒙语授课班3个（初一至初三各1个班）。蒙授高中的三个年级中每个年级的1、2班为理科实验班，4班为文科普通班，3班为理科普通班，5班为文科实验班。汉授高一至高三每个年级的6，7，8班为宏志班。在2008年内蒙古师大附中推出了自治区首个国际部，培养以出国留学为目标的学生。同样是在2008年内蒙古师大附中还增加了蒙语授课文科实验班，为培养少数民族人才作出重要贡献。在校学生3000 余人，其中，蒙语授课班学生约620人，少数民族学生约占全校学生总数的二分之一。
学校师资队伍整体稳定，职称结构合理，业务水平较高。现有教职工219人（少数民族教职工82人），其中专任教师179人。专任教师中，有教授1人，副教授1人，特级教师3人，硕士研究生导师6人，高级教师85人，中级教师52人，初级教师42人，具有本科以上学历的任课教师占专任教师总数的98%，已具有研究生学历和在读研究生34人。
由于办学成绩突出，学校受到上级部门和社会各界的肯定和称赞，曾多次获得各种表彰和奖励，并荣获多种光荣称号，被评为“内蒙古自治区首批重点高中”、“内蒙古自治区首批示范性普通高中”、“全区民族教育先进集体”、“高考状元学校”、“现代教育技术优秀学校”、“培养体育后备人才优秀试点学校”、“中国校园网暨校校通工程示范校”、“教育部中西部中小学网络教室示范校”，连续四年获呼和浩特市教育局长特别奖，是中国中学远程教育联盟暨全国中学远程教育专业委员会理事学校，全国知名中学科研联合体成员学校。
从2008-2009学年下学期起，在每周三和周五课间操之前，各年级的语文老师会领读国学的经典。并且由老师讲解其中的深刻道理。后来，一些非语文教师也开始上台讲解。经典朗读的第一篇篇目是《论语》，第二篇是《弟子规》。现在，经典朗读由学生在周三周五课间操之后领读并讲解。其中，蒙语授课部的学生还会用蒙语和汉语分别诵读、讲解。
新生在入学前都会在校内经历为期一周的军训，军训内容都是一些基础的动作。军训期间还会有军事知识讲座。军训结束后会有军训的会演，要唱军歌、校歌、表演军体拳、阅兵。结束后会给前三名颁奖，比赛上没得奖的一般会得一个优秀集体奖。军训虽然比较艰苦但是对于每个班级和个人来说都是受益匪浅的。
★校歌
附中有一首体现本校办学精神的校歌，歌词如下：
我们的学校是塞上明珠，在北疆大地上闪闪发光
我们的老师是人生的灯塔，召唤着青年们胜利起航。
{1.我们是一群民族的精英，从草原从青城汇聚一堂
奋发向上，不负春光。从知识大海里汲取力量。
努力拼搏，像草原的雄鹰。灿烂的青春，像蓬勃的太阳。}
{2.我们是一代民族之魂，又勤劳又勇敢无比坚强
远大的理想像瑰丽的彩虹，健壮的身体像挺拔的白杨。
今天承接着阳光雨露，明天是祖国的栋梁。}
是在校团委直接领导下的最大的学生组织，由8个分工不同的部门构成，作为代表和维护学生利益的学生组织，学生会的工作渗透到学生在校日常生活的各个方面。学生会力争及时解决同学们的所急所需，同时搭建一个充分体现自我风采、实现自我价值的舞台。
附中素来提倡素质教育，要求德智体美全面发展，并要求新生入学时就要求学生尊重少数民族风俗习惯，提倡蒙授、汉授学生和睦相处。MC社团就是为了协助学校更好的实现这些想法而成立的，实事求是是MC社团的理念。
2001年12月13日，中学生通讯社内蒙古分社师大附中记者站正式成立，记者站每年都会招收新成员，培训合格后，小记者开始进行校内各种采访活动，及时报道校内各项文体活动。
最大特点就是以青少年为主，从发起组织到行动是由青少年自己来办的，这样以来，不仅在宣传效果上不同凡响，而且更重要的是环保知识的宣传对青少年的行为举动以有潜移默化的作用。
跆拳道具有防身健体、修身养性的作用，为了增强学生体质、培养学生意志品质，活动时间为周三、四的课外活动时间。通过跆拳道训练，培养同学们坚忍不拔、勇敢无畏、顽强坚毅的意志品质